Det er foreløpig ingen informasjon om virus rettet mot Nook Color-systemet. Det er nyere bevis for skadelig programvare som påvirker Android-mobilsystemer, men Nook Color bruker bare en sterkt modifisert versjon av Android 2.2 Froyo som en kjernedel av programvareplattformen, som for øyeblikket ikke er målrettet mot moderne skadevareapplikasjoner.