Virus kan gjemme seg i
begge av de viktigste oppstartsområdene på en harddisk:
* Master Boot Record (MBR): Dette er den aller første sektoren på harddisken og inneholder viktig informasjon for å starte opp operativsystemet. Et virus i MBR kan forhindre at operativsystemet lastes riktig.
* oppstartssektor: Dette er den første sektoren i partisjonen der operativsystemet er installert. Et virus i oppstartssektoren kan forhindre at operativsystemet laster riktig eller utfører ondsinnet kode når datamaskinen starter.
Det er viktig å merke seg at selv om dette er de vanligste stedene for oppstartsvirus å skjule, kan de også finnes i andre områder på harddisken, for eksempel filsystemet eller registeret.