Filsystemet som brukes av SDXC-minnekort er exFAT (Extended File Allocation Table). Dette filsystemet ble utviklet av Microsoft og er designet for bruk med flash-minnekort, for eksempel SDXC-kort. exFAT støtter filer større enn 4 GB og kan formateres på både Windows- og Mac-operativsystemer.
