Windows 2000 Active Directory er lagret i følgende tre filer:
* Ntds.dit: Ntds.dit-filen inneholder katalogdatabasen, som inkluderer skjema, konfigurasjon og data for alle objekter i katalogen.
* Edb.log: Edb.log-filen er transaksjonsloggen for Ntds.dit-filen. Den registrerer alle endringer som gjøres i katalogdatabasen, og den brukes til å gjenopprette databasen hvis den blir skadet.
* Res1.log: Res1.log-filen er en sekundær transaksjonsloggfil som brukes til å gjenopprette katalogdatabasen hvis Edb.log-filen går tapt.