En ren installasjon lar deg starte på nytt med et nytt operativsystem, uten noen av de gamle filene og innstillingene fra Windows 98. Dette kan bidra til å forbedre ytelsen og stabiliteten, og det kan også bidra til å løse eventuelle kompatibilitetsproblemer som kan oppstå med maskinvare eller programvare. I tillegg kan en ren installasjon bidra til å fjerne eventuelle virus eller skadelig programvare som kan ha infisert systemet.