PDB filtypen står for " protein data bank" og inneholder i den tekst som beskriver den tredimensjonale strukturen av molekylære proteiner . Det brukes for å lagre informasjon i protein- databank , som er en stadig voksende database som viser alle de kjente proteiner . Den FASTA filtypen brukes av DNA-analyse programvare for å lage todimensjonale representasjoner av proteiner og vurdere deres likhet . PDB -filer kan konverteres til FASTA filer , slik at disse to- dimensjonale representasjoner av proteiner kan studeres . De to- dimensjonale representasjoner er langt enklere å analysere og sammenligne enn den tredimensjonale versjonen , og det er av denne grunn at forskere noen ganger foretrekker å gjøre sitt arbeid i FASTA programvare. Du trenger
datamaskin med Windows XP , Vista eller 7
Vis flere instruksjoner
en
Last ned den Advanced Protein Sequence Converter knyttet i Resources . Dette er den eneste tilgjengelig programvare som vil konvertere PDB til FASTA .
2
Installer Advanced Protein Sequence Converter på datamaskinen.
3
Åpne avansert Protein sekvens Converter program .
4
Klikk på "File " og deretter " Åpne fil ".
5
Velg PDB filen fra nettleseren vinduet som åpnes.
6
Klikk "Open".
7
Velg " til FASTA Format" i " Export " overskriften på nedre høyre side av programmet .
8 < p > Klikk "Alternativer" og deretter " Innstillinger ".
9
Velg strenglengde du foretrekker din FASTA filen som skal eksporteres til .
10
Klikk " OK ».
11
Klikk på " Export "-knappen . Din PDB filen vil nå bli omgjort til en FASTA fil med protein hyssinglengder at du skal dekke.