Bioperl er en populær open source prosjekt som gir et omfattende bibliotek av moduler for å håndtere og manipulere data knyttet til biovitenskap . Forskere bidrar til Bioperl moduler som er skrevet i programmeringsspråket Perl . Mange forskere og ingeniører bruker MATLAB , et høyt nivå programmeringsspråk utviklet av Mathworks for teknisk databehandling. MATLAB er populær i både akademia og industri fordi språket gjør at brukerne raskt opprette kode for å analysere data , utvikle algoritmer og skape visualiseringer . Snarere enn lære Perl , kan du dra nytte av Bioperl funksjoner ved å ringe Bioperl moduler fra MATLAB , og dermed dra nytte av dine eksisterende kunnskap om MATLAB i tillegg til kraften i de Bioperl moduler. Instruksjoner
en
Installer Bioperl på systemet, ved å følge instruksjonene som passer til ditt operativsystem på Bioperl nettsiden ( Bioperl.org ) .
2
Type " perl ( ' BioPerlModule ') "i MATLAB kommandoen vinduet der" BioPerlModule "erstattes med navnet på BioPerl modul som du ønsker å kjøre .
3
å utføre en BioPerl modul som krever inndata argumenter , skriv " perl (' BioPerlModule ', ' arg1 ' , ' arg2 ', ... )" , der " BioPerlModule " erstattes med navnet på BioPerl modul og "' arg1 ', ' arg2 ', ... " er erstattet med navnene på de variablene du vil bruke som BioPerl modul argumenter.