I sammenheng med et hierarkisk filsystem er rotkatalogen toppnivåkatalogen til et filsystem eller lagringsenhet. Det er det høyeste nivået i katalogtreet og inneholder alle andre underkataloger og filer i det. Rotkatalogen er vanligvis merket med et skråstrek (/)-tegn.

Underkataloger er mapper eller kataloger som er opprettet i rotkatalogen eller andre underkataloger. De tillater bedre organisering og kategorisering av filer ved å lage en hierarkisk struktur. Underkataloger kan inneholde filer, andre underkataloger eller en kombinasjon av begge.

Her er en forenklet representasjon av forholdet mellom en rotkatalog og en underkatalog:

Rotkatalog (/)

|

|-- Underkatalog 1 (/)

|

|-- Fil 1.txt

|-- Underkatalog 1.1

|

|-- Fil 1.1.1

|-- Underkatalog 2

|

|-- Fil 2.txt

I dette eksemplet representerer "/" rotkatalogen, "Underkatalog 1" og "Underkatalog 2" er to underkataloger i rotkatalogen, "Fil 1.txt" og "Fil 2.txt" er filer i underkatalogene, og " Underkatalog 1.1" er en annen underkatalog opprettet i "Underkatalog 1".

Underkataloger gir bedre administrasjon og tilgjengelighet til filer ved å gruppere dem logisk og lage en nestet struktur. Brukere kan navigere gjennom underkataloger og få tilgang til filer i dem ved å spesifisere banene deres i forhold til rotkatalogen.