Det er noen få måter å åpne en PDB-fil på.

Bruk et tekstredigeringsprogram.

PDB-filer er vanlige tekstfiler, så du kan åpne dem med et hvilket som helst tekstredigeringsprogram, for eksempel Notisblokk eller WordPad. Du vil imidlertid ikke kunne se 3D-strukturen til molekylet i et tekstredigeringsprogram.

Bruk en PDB-visning.

Det er mange forskjellige PDB-visningsprogrammer tilgjengelig, både gratis og kommersielle. Noen populære alternativer inkluderer:

- PyMOL: En gratis og åpen kildekode PDB-visningsprogram med et bredt spekter av funksjoner.

- VMD: En gratis og åpen kildekode PDB-visningsprogram som er spesielt godt egnet for å visualisere store molekyler.

- Kimera: En kommersiell PDB-viser som er kjent for sitt brukervennlige grensesnitt og omfattende funksjonssett.

For å åpne en PDB-fil i en PDB-visning, velg ganske enkelt Fil> Åpne menyelementet og bla til PDB-filen du vil åpne. PDB-visningen vil deretter laste filen og vise 3D-strukturen til molekylet.

Bruk en nettleser.

Det finnes også en rekke nettlesere som kan vise PDB-filer. Noen populære alternativer inkluderer:

- RCSB Protein Data Bank: Den offisielle nettsiden til Protein Data Bank, som er vert for en stor samling av PDB-filer.

- Mol* Viewer: En gratis og åpen kildekode nettbasert PDB-visningsprogram som lar deg se 3D-strukturen til molekyler i nettleseren din.

- JSmol: En gratis og åpen kildekode Java-basert PDB-visningsprogram som lar deg se 3D-strukturen til molekyler i nettleseren din.

For å åpne en PDB-fil i en nettleser, kopier og lim inn PDB-ID-en i søkefeltet i nettleseren. Nettleseren vil da laste PDB-filen og vise 3D-strukturen til molekylet.