FLAC-filstørrelser varierer avhengig av lydinnholdet, men vanligvis er de større enn MP3-filer. En gjennomsnittlig FLAC-filstørrelse kan variere fra 20 til 50 megabyte (MB) per minutt med lyd, mens en MP3-fil med samme lengde kan være rundt 3 til 5 MB. I tillegg kan filstørrelsen til en FLAC-fil påvirkes av samplingshastigheten, bitdybden og antall kanaler.
