Det kan være farlig å redigere MS-DOS Config.sys-filen med en tekstbehandler fordi Config.sys-filen inneholder kritiske systeminnstillinger og eventuelle feil eller feil formatering kan føre til at systemet ikke starter opp eller på annen måte fungerer feil. Tekstbehandlere er ikke utviklet spesielt for å redigere systemkonfigurasjonsfiler og kan introdusere utilsiktede endringer eller formateringsfeil som kan ha uforutsigbare konsekvenser.

For eksempel, hvis en tekstbehandler endrer mellomrom eller innrykk på en linje i Config.sys-filen, kan det forstyrre måten operativsystemet tolker innstillingene på. I tillegg kan tekstbehandlere sette inn skjulte tegn eller formateringskoder i filen som ikke er kompatible med operativsystemet og kan forårsake feil.

For å unngå disse risikoene, anbefales det å bruke et tekstredigeringsprogram som er spesielt utviklet for å redigere systemkonfigurasjonsfiler, for eksempel MS-DOS Editor (Rediger) eller en tredjeparts tekstredigerer med de riktige funksjonene. Disse redaktørene sikrer at filen er riktig formatert og fri for feil som kan forårsake systemproblemer.