BAM filer er binære formater av sequencer lesere. De lagrer vitenskapelige nukleotid data i et komprimert format , blande både justert og unaligned leser sammen. De styres med " bam2fastq "-verktøyet, en datamaskin kommando som kommer installert med mange nukleotid - sekvensering programmer ( du kan også få den gratis. ) Til å trekke ut unaligned leser fra en BAM -fil , så er alt du trenger Windows kommandolinjen. Instruksjoner
en
Type " bam2fastq " i Start-menyen søkelinjen å sikre at du har verktøyet (du trenger ikke å åpne den. ) Hvis du ikke gjør det, får det gratis i Resources .
2
Type " cmd.exe " i Start-menyen søkefeltet. Klikk " cmd.exe " når det vises over . Dette åpner vinduene kommandolinjen
3
Type. " Bam2fastq - unaligned FILELOCATION.bam " ( uten anførselstegn) i kommandovinduet
4
Erstatt. " FILELOCATION " med plasseringen av BAM -filen. Bruk format C: . . \\ 1 Mappe \\ mappe2 \\ File.bam "
5
Hit " Enter "Dette vil dukke opp en tekst vindu med unaligned leser fra den aktuelle BAM -fil < . br >