Det er vanligvis ingen oppstartspartisjon hvis du ikke bruker partisjoner, i så fall bør du sette roten til filsystemet i begynnelsen av disken.

Hvis du bestemmer deg for å bruke en enkelt partisjon for hele disken, kan du fortsatt ha en separat oppstartspartisjon. For å gjøre dette, må du lage en liten partisjon (omtrent 512 MB i de fleste tilfeller) på begynnelsen av disken og formatere den med et passende filsystem (vanligvis FAT32). Du må da installere bootloader (som GRUB) til denne partisjonen. Resten av disken vil da være tilgjengelig for rotpartisjonen.

Et annet alternativ er å bruke en partisjonstabelltype som støtter partisjonstyper over 4 primære partisjoner, hvis BIOS eller UEFI støtter det. Ellers kan du enten bruke et LVM-oppsett, eller bare dele disken i partisjoner direkte uten å bruke noen partisjonstabell, ved å bruke fdisk uten å lage en partisjonstabell (bare spesifiser startsektoren for hver partisjon). Dette oppsettet kalles DOS-hybridmodus.