Følgende alternativer er tilgjengelige på oppstartsmenyen for Windows 9xMe:
* Normal - Dette er standardalternativet og vil starte Windows på vanlig måte.
* Sikker modus - Dette alternativet starter Windows i en begrenset tilstand med minimale drivere og tjenester lastet, noe som kan være nyttig for feilsøking av problemer.
* Sikker modus med nettverk - Dette alternativet starter Windows i sikkermodus, men laster også nettverksdriverne og -tjenestene, noe som kan være nyttig for feilsøking av nettverksproblemer.
* Sikker modus med ledetekst - Dette alternativet starter Windows i sikkermodus, men i stedet for det grafiske brukergrensesnittet, vises en ledetekst, som kan være nyttig for avansert feilsøking.
* MS-DOS-modus - Dette alternativet starter Windows i MS-DOS-modus, som er et tekstbasert operativsystem som var tilgjengelig før Windows.
* Oppstartsmeny - Dette alternativet viser oppstartsmenyen igjen, som lar deg velge et annet alternativ.
