Trine Bekkby er utdannet biolog fra Universitetet i Oslo, med fagkompetanse innen marin økologi. Leder forskningsprosjekter innen tareskogsøkologi og utbredelse av marine arter and naturtyper langs miljøgradienter. Har siden 2009 vært faglig koordinator for Nasjonalt program for kartlegging av biologisk mangfold – kyst.

Jobber ved Norsk institutt for vannforskning (NIVA). NIVA er et nasjonalt forskningsinstitutt som utfører forskning, utviklingsarbeid og utredninger, og som bidrar med kunnskap om, og løsninger på, nasjonale og internasjonale vannfaglige spørsmål. Hører til NIVAs Fagsenter for kyst og hav, Seksjon for Marin biologi. 

Innehar også en Forsker II-stilling ved Universitetet i Oslo, Naturhistorisk museum, Geo-økologisk forskningsgruppe (GEco), en gruppe som arbeider med å forstå hvorfor arter og naturtyper fordeler seg i naturen som de gjør.